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预览版 · 本地计算 · 数据不上传

/roadmap/

路线图 内测中

现在做到什么、下一步需要什么条件、再往后的空间。

现在做到

可验证:链到页面与自动化测试用例。

  1. 项目与工作区 · 本地项目空间(IndexedDB) 内测中

    验收用例 W1–W5

  2. 项目与工作区 · 导入导出项目 JSON、导出 SDF 内测中

    验收用例 W1–W5

  3. 项目与工作区 · 任务与交付看板(按六步链路、交付记录、CSV 导出) 内测中

    验收用例 W1–W5

  4. 靶点检索与结构 · 靶点检索(UniProt 已审核条目,基因名/UniProt 号/PDB 号) 内测中

    验收用例 T1–T6

  5. 靶点检索与结构 · 实验结构列表(分辨率条形图、年份、共晶配体)与 AlphaFold 预测结构 内测中

    验收用例 T1–T6

  6. 靶点检索与结构 · 三维查看器(3Dmol.js 自托管):内置示例 1M17 离线查看、本地 PDB/mmCIF 上传 内测中

    验收用例 T1–T6

  7. 靶点检索与结构 · 共晶配体加入分子集、送去相似性检索 内测中

    验收用例 T1–T6

  8. 苗头发现 · 相似性检索(Morgan r2) 内测中

    验收用例 S1、S4、S5

  9. 苗头发现 · 虚拟筛选漏斗 内测中

    验收用例 S1、S4、S5

  10. 苗头发现 · 子结构检索(SMARTS,命中原子高亮) 内测中

    验收用例 S1、S4、S5

  11. 苗头发现 · 五种指纹可选(Morgan、MACCS、Atom-pair、拓扑扭转、RDKit 路径) 内测中

    验收用例 S1、S4、S5

  12. 分子优化 · R 基枚举(笛卡尔积,上限 2000,超出提示截断数) 内测中

    验收用例 —

  13. 分子优化 · 骨架替换(表驱动,26 条环系与电子等排体规则) 内测中

    验收用例 —

  14. 分子优化 · Matched molecular pair(单切) 内测中

    验收用例 —

  15. 分子优化 · R 基分解与 SAR 表 内测中

    验收用例 —

  16. 分子优化 · MPO 雷达(默认方案与 CNS MPO 四参数近似) 内测中

    验收用例 —

  17. 性质与 ADMET · 性质、Lipinski/Veber、成药性雷达 内测中

    验收用例 A1、A2

  18. 性质与 ADMET · PAINS/Brenk 结构警示 内测中

    验收用例 A1、A2

  19. 性质与 ADMET · QED 类药性(八项子分) 内测中

    验收用例 A1、A2

  20. 性质与 ADMET · 批量计算(含 QED 列)与 CSV 导出 内测中

    验收用例 A1、A2

  21. 性质与 ADMET · Ghose/Egan/Muegge 规则与 BOILED-Egg 图 内测中

    验收用例 A1、A2

  22. 三维结构 · 示例库分子三维(离线预算构象) 内测中

    验收用例 D2

  23. 三维结构 · 打开本地 PDB/mmCIF 文件(与靶点页同一 3Dmol.js 查看器,请在靶点页上传) 内测中

    验收用例 D2

  24. 三维结构 · 打开本地 SDF/MOL 文件(V2000,三维坐标) 内测中

    验收用例 D2

  25. 合成 · 反应枚举(12 条反应模板+自填反应 SMARTS) 内测中

    验收用例 —

  26. 报告与导出 · 单文件 HTML 报告(内嵌结构图,离线可开) 内测中

    验收用例 R1–R4

  27. 报告与导出 · CSV、SDF 导出 内测中

    验收用例 R1–R4

  28. 天然产物与中药成分 · 天然产物卡片库(116 条,按化学类别筛选、按名称或 CID 查找) 内测中

    验收用例 N1–N4

  29. 天然产物与中药成分 · 详情:性质、QED、结构警示、相似已上市药,加入分子集 内测中

    验收用例 N1–N4

下一步

设计已定、浏览器可行性已实测,写明开放条件。

  1. 性质与 ADMET · SA score 合成可及性 开发中

    需在浏览器复刻 RDKit 的 Morgan 环境哈希并与 Python sascorer 对拍(误差 <0.01),或服务端计算。

  2. 三维结构 · PubChem 三维构象 开发中

    需联网开关接入 PubChem 3D 接口。

  3. 合成 · 合成可及性打分 开发中

    随 SA score 一起。

再往后

需要服务端算力、外部数据或模型;不写日期,只写达成条件。

  1. 项目与工作区 · 云端账号与多人协作 规划中

    需要服务端认证、数据库与备份、隐私说明与数据删除机制、服务端强制的访问控制,并完成上线前安全自测。

  2. 靶点检索与结构 · 口袋自动识别 规划中

    需 fpocket 类算法的浏览器版本或服务端计算;在此之前只高亮结构文件里真实存在的共晶配体。

  3. 苗头发现 · 全库(PubChem/ChEMBL 级)相似性检索 规划中

    需服务端指纹索引(内存 ≥32 GB)。

  4. 分子优化 · 生成式设计 规划中

    需生成模型推理服务与化学有效性、新颖性评估流程;结果须标“模型生成、未经合成验证”。

  5. 性质与 ADMET · 模型型 ADMET(溶解度、hERG、CYP 等) 规划中

    模型与训练数据来源可公开核实、有外部测试集指标,每个预测附适用域提示。

  6. 三维结构 · 任意输入分子的在线构象生成 规划中

    当前 RDKit.js minimal 版不含三维嵌入(已实测);需自编译带 DistGeom 的版本或服务端 ETKDG。

  7. 三维结构 · 分子对接 规划中

    需受体准备与口袋定义流程、AutoDock Vina 或 gnina 服务端算力与任务队列;结果附打分函数局限说明,不写成结合亲和力实测。

  8. 合成 · 逆合成路线 规划中

    需 AiZynthFinder(MIT)或同类工具的服务端部署、可公开来源的反应模板与可购买原料库;每条路线附模板来源与置信度。

  9. 报告与导出 · PDF 直出 规划中

    现可用浏览器“打印为 PDF”打开 HTML 报告得到 PDF。

  10. 天然产物与中药成分 · COCONUT、LOTUS 等开放库全库检索 规划中

    确认许可证,离线子集或服务端检索。

  11. 平台 · 账号与云端项目空间 规划中

    需服务端与数据库、用户协议与隐私条款、数据备份;达成前项目只存在访问者本机浏览器(见 /workspace/),不收集任何账号信息。

  12. 平台 · 管理后台 规划中

    随账号体系一起建:内容与示例库维护、示例数据来源与授权核验视图(逐条 CID 与许可)、模块状态词发布审核;达成前本站没有管理后台,数据清单与状态词在构建时生成并公示于本页。