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靶点检索与结构 内测中
从一个基因名或蛋白名出发,确认是哪个蛋白、有哪些实验与预测结构、口袋里坐着什么配体。
检索靶点
靶点检索需要先打开右上角的「联网查询」开关:浏览器会直连 UniProt、RCSB PDB 与 AlphaFold DB,只发送你输入的检索词。
选择一个结构后在这里显示。
拖动旋转,滚轮缩放。
这一页的数据从哪来
靶点卡:UniProtKB 已审核条目(rest.uniprot.org);实验结构列表与分辨率:UniProt 交叉引用的 PDB 条目,年份与共晶配体取自 RCSB PDB(data.rcsb.org);结构文件从 files.rcsb.org 下载;预测结构与平均 pLDDT 取自 AlphaFold DB(alphafold.ebi.ac.uk)。三维显示用 3Dmol.js(BSD-3),随页面自托管。联网查询关闭时本页不发出任何网络请求。内置示例 1M17 为 RCSB 原始文件的离线副本,下载日期写在结构说明里。口袋自动识别尚未提供,页面高亮的是结构文件里真实存在的共晶配体。
本页能力与状态
| 能力 | 状态 | 接入条件/说明 |
|---|---|---|
| 靶点检索(UniProt 已审核条目,基因名/UniProt 号/PDB 号) | 内测中 | 需开启联网查询;浏览器直连 rest.uniprot.org,只发送检索词。查无结果显示“未找到”,连不上时提示降级。 |
| 实验结构列表(分辨率条形图、年份、共晶配体)与 AlphaFold 预测结构 | 内测中 | 需开启联网查询;数据直连 RCSB PDB 与 AlphaFold DB。 |
| 三维查看器(3Dmol.js 自托管):内置示例 1M17 离线查看、本地 PDB/mmCIF 上传 | 内测中 | 离线可用,不联网。 |
| 共晶配体加入分子集、送去相似性检索 | 内测中 | 已开放,经自动化测试验证 |
| 口袋自动识别 | 规划中 | 需 fpocket 类算法的浏览器版本或服务端计算;在此之前只高亮结构文件里真实存在的共晶配体。 |